Dalam pelaksanaan kegiatan akademika di lingkup universitas Trunojoyo Madura, Fakultas Keislaman memiliki Visi serta Misi yang diemban dalam perjalanan fakultas ini. Adapun Visi dan Misi Fakultas Keislaman sebagai berikut:
Visi
Unggul dalam pendidikan dan riset di bidang IlmuKeislaman, Berkarakter Islami dan Berdaya saing Nasional pada tahun 2020
Misi
- Menyelenggarakan pendidikan yang unggul di bidang Ilmu Keislaman
- Meningkatkan kualitas dosen dalam bidang pengajaran, penelitian dan pengabdian.masyarakat yang menunjang penerapan dan pengembangan Ilmu Keislaman
- Menfasilitasi terbentuknya Insan Fakultas Kislaman berkarakter Islami
- Mengembangkan kerjasama dengan berbagai pihak untuk meningkatkan pelaksanaan tri dharma Perguruan Tinggi